3.11. 54KJPN-STR

Dataset category

Genome Variation

Overview

Short tandem repeat allele frequency data obtained from short-read whole genome sequencing of about 54,000 Japanese individuals

Method

54KJPN-SNV/INDEL で作成したCRAMファイルに対して Expansion Hunter 5.0.0 を実行した。 カタログには Repeat Catalogs を利用している。それぞれの検体に対して Expansion Hunter を実行した後、 結合して頻度を計算した。

Samples analyzed

Same as 54KJPN-SNV/INDEL

Number of samples (by analysis platform)

Same as 54KJPN-SNV/INDEL

Number of samples (by age)

Same as 54KJPN-SNV/INDEL

Related pages on the jMorp website