3.2. 38KJPN-SNV/INDEL

データセットカテゴリ

Genome Variation

概要

日本人約 38,000 人の短鎖全ゲノム解析から得られた SNV/INDEL アレル頻度・ジェノタイプ頻度データ

参考文献

  • Tadaka et al. [2]

解析対象

血液 (Buffy coat)・唾液

検体数 (解析プラットフォーム別)

解析プラットフォーム

男性

女性

合計

Illumina HiSeq 2500 (162PE)

1,337

1,555

2,892

Illumina HiSeq 2500 (259PE)

136

189

325

Illumina HiSeq X Five (150PE)

31

32

63

Illumina NovaSeq 6000 (150PE)

3,888

13,519

17,407

Illumina NovaSeq 6000 (151PE)

467

703

1,170

Illumina NovaSeq 6000 (161PE)

1,858

6,888

8,746

MGI DNBSeq G400 (150PE)

587

656

1,243

MGI DNBSeq T7 (150PE)

2,977

3,899

6,876

合計

11,281

27,441

38,722
検体数 (年齢別)

年齢

男性

女性

合計

19以下

39

102

141

20代

928

5,444

6,372

30代

2,483

9,376

11,859

40代

1,110

2,370

3,480

50代

1,074

2,906

3,980

60代

3,860

5,535

9,395

70代

1,737

1,675

3,412

80以上

50

33

83

合計

11,281

27,441

38,722
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