3.6. 61KJPN-SNV/INDEL
- データセットカテゴリ
Genome Variation
- 概要
日本人約 61,000 人の短鎖全ゲノム解析から得られた SNV/INDEL アレル頻度・ジェノタイプ頻度データ
- 参考文献
Tadaka et al. [2]
- 解析対象
血液 (Buffy coat)・唾液
- 検体数 (解析プラットフォーム別)
解析プラットフォーム
男性
女性
合計
Illumina HiSeq 2500 (162PE)
1,314
1,559
2,873
Illumina HiSeq 2500 (259PE) *1
107
174
281
Illumina HiSeq X Five (150PE) *1
31
34
65
Illumina NovaSeq 6000 (150PE) *2
4,209
14,271
18,480
Illumina NovaSeq 6000 (151PE) *2
1,495
2,224
3,719
Illumina NovaSeq 6000 (161PE)
9,182
15,415
24,597
Illumina NovaSeq X Plus (161PE)
922
2,553
3,475
MGI DNBSeq G400 (150PE) *1
528
560
1,088
MGI DNBSeq T7 (150PE)
2,954
3,892
6,846
合計
20,742
40,682
61,424
*1 サンプル数が少ないため、jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは解析プラットフォーム別の頻度情報を表示しておりません。
*2 jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは 150PE と 151PE を合算して 150PE と表示しています。
- 検体数 (年齢別)
年齢
男性
女性
合計
19以下
726
724
1,440
20代
1,347
5,851
7,198
30代
3,263
10,398
13,661
40代
1,862
3,780
5,642
50代
2,143
5,471
7,614
60代
7,525
10,635
18,160
70代
3,770
3,742
7,512
80以上
106
81
187
合計
20,742
40,682
61,424
- jMorp Web サイトにおける掲載ページ