3.12. Metagenome 16S-v4

Dataset category

Phenome

Summary

Microbiome analysis data of plaque/saliva samples (16S v4 region analysis)

References
  • Saito et al. [12]

Samples analyzed

Plaque, saliva

Number of samples

1,289 samples

Analysis platform

Illumina MiSeq

item ID rule

Metagenome 16s-v4 2021 データセットに含まれる微生物種にはその種ごとに TTAx_1234 のようなIDが付与されています。 先頭の TTToMMo Taxonomy の略です。 3文字目の AMetagenome 16S-v4 データセットのIDであることを示します。 (Metagenome 16S-v3/v4 データセットの ID と区別するための識別子です。) 4文字目は微生物種の階層を示します。 (TTAP_xxxx = Phylum, TTAC_xxxx = Class, TTAO_xxxx = Order, TTAF_xxxx = Family, TTAG_xxxx = Genus, TTAS_xxxx = Species)

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