3.4. 54KJPN-SNV/INDEL
- データセットカテゴリ
Genome Variation
- 概要
日本人約 54,000 人の短鎖全ゲノム解析から得られた SNV/INDEL アレル頻度・ジェノタイプ頻度データ
- 参考文献
Tadaka et al. [2]
- 解析対象
血液 (Buffy coat)・唾液
- 検体数 (解析プラットフォーム別)
解析プラットフォーム
男性
女性
合計
Illumina HiSeq 2500 (162PE)
1,450
1,677
3,127
Illumina HiSeq 2500 (259PE) [1]
142
189
331
Illumina HiSeq X Five (150PE) [1]
32
35
67
Illumina NovaSeq 6000 (150PE) [2]
4,913
15,387
20,300
Illumina NovaSeq 6000 (151PE) [2]
1,605
2,301
3,906
Illumina NovaSeq 6000 (161PE)
6,291
11,624
17,915
MGI DNBSeq G400 (150PE) [1]
620
671
1,291
MGI DNBSeq T7 (150PE)
3,210
4,155
7,365
合計
18,263
36,039
54,302
[1] サンプル数が少ないため、jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは解析プラットフォーム別の頻度情報を表示しておりません。
[2] jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは 150PE と 151PE を合算して 150PE と表示しています。
- 検体数 (年齢別)
年齢
男性
女性
合計
19以下
233
1292
525
20代
1,099
5,817
6,916
30代
2,865
10,024
12,889
40代
1,686
3,037
4,723
50代
2,030
4,420
6,450
60代
7,047
9,329
16,376
70代
3,246
3,077
6,223
80以上
57
43
100
合計
18,263
36,039
54,302
- jMorp Web サイトにおける掲載ページ