3.5. 60KJPN-SNV/INDEL
- データセットカテゴリ
Genome Variation
- 概要
日本人約 60,000 人の短鎖全ゲノム解析から得られた SNV/INDEL アレル頻度・ジェノタイプ頻度データ
- 参考文献
Tadaka et al. [2]
- 解析対象
血液 (Buffy coat)・唾液
- 検体数 (解析プラットフォーム別)
解析プラットフォーム
男性
女性
合計
Illumina HiSeq 2500 (162PE)
1,425
1,652
3,077
Illumina HiSeq 2500 (259PE) *1
139
182
321
Illumina HiSeq X Five (150PE) *1
32
35
67
Illumina NovaSeq 6000 (150PE) *2
4,911
15,201
20,112
Illumina NovaSeq 6000 (151PE) *2
1,629
2,357
3,986
Illumina NovaSeq 6000 (161PE)
9,213
14,649
23,862
MGI DNBSeq G400 (150PE) *1
600
641
1241
MGI DNBSeq T7 (150PE)
3,179
4,095
7,274
合計
21,128
38,812
59,940
*1 サンプル数が少ないため、jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは解析プラットフォーム別の頻度情報を表示しておりません。
*2 jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは 150PE と 151PE を合算して 150PE と表示しています。
- 検体数 (年齢別)
年齢
男性
女性
合計
19以下
533
549
1,082
20代
1,695
5,826
7,521
30代
3,915
10,360
14,275
40代
1,932
3,469
5,401
50代
2,165
5,178
7,343
60代
7,462
10,158
17,620
70代
3,366
3,227
6,593
80以上
60
45
105
合計
21,128
38,812
59,940
- jMorp Web サイトにおける掲載ページ