3.5. 60KJPN-SNV/INDEL

Dataset category

Genome Variation

Overview

SNV/INDEL allele frequency and genotype frequency data obtained from short-read whole genome sequencing of about 60,000 Japanese individuals

References
  • Tadaka et al. [2]

Samples analyzed

Blood (buffy coat), saliva

検体数 (解析プラットフォーム別)

解析プラットフォーム

男性

女性

合計

Illumina HiSeq 2500 (162PE)

1,425

1,652

3,077

Illumina HiSeq 2500 (259PE) *1

139

182

321

Illumina HiSeq X Five (150PE) *1

32

35

67

Illumina NovaSeq 6000 (150PE) *2

4,911

15,201

20,112

Illumina NovaSeq 6000 (151PE) *2

1,629

2,357

3,986

Illumina NovaSeq 6000 (161PE)

9,213

14,649

23,862

MGI DNBSeq G400 (150PE) *1

600

641

1241

MGI DNBSeq T7 (150PE)

3,179

4,095

7,274

合計

21,128

38,812

59,940

*1 サンプル数が少ないため、jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは解析プラットフォーム別の頻度情報を表示しておりません。

*2 jMorp Web サイト、およびダウンロードファイルでは 150PE と 151PE を合算して 150PE と表示しています。

検体数 (年齢別)

年齢

男性

女性

合計

19以下

533

549

1,082

20代

1,695

5,826

7,521

30代

3,915

10,360

14,275

40代

1,932

3,469

5,401

50代

2,165

5,178

7,343

60代

7,462

10,158

17,620

70代

3,366

3,227

6,593

80以上

60

45

105

合計

21,128

38,812

59,940

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