1.3. Web サイト構成
jMorp Webサイトは以下のような構成になっています。

- トップページ
jMorp 収録データの一括検索
カテゴリ別索引
- 遺伝子ページ
遺伝子ID・名前
SNV/INDEL リスト・アレル頻度情報
メチル化情報
遺伝子発現情報
ゲノムブラウザ
GWAS 解析情報
- SNV/INDEL ページ
dbSNP・ClinVar アノテーション
Japonica Array搭載状況
アレル・ジェノタイプ頻度
遺伝子アノテーション
GWAS解析情報
LiftOver
- CNV ページ (図には未掲載)
コピー数の頻度
- STR ページ (図には未掲載)
リピート数の最小値、平均値、中央値、最大値
- SNV/INDEL構造マッピングツール
SNV/INDEL をタンパク質構造にマッピングした結果
- ゲノムブラウザ
ゲノム配列 (JG2.1.0)
SNV/INDEL
SV
メチル化
Genome Accessibility
- 代謝物ページ
化合物名称・各種外部データベースへのリンク
構造
[NMR] 自動定量の精度
[MS] 代謝物及びadduct ionの m/z・retention time
intensity 分布 (一般集団・時系列変化・妊娠による変化)
化合物間の相関関係データ
GWAS解析結果
- 代謝物相関ネットワークビューワー
化合物間の相関関係をネットワーク (グラフ) として表示・探索
- GWASページ
TMMで行われたGWAS解析の研究サマリー
要約統計量ファイルダウンロード
マンハッタンプロット・QQプロット表示
- MRI ページ (図には未掲載)
脳MRI画像情報に基づく各部位の容積情報
- PGxページ
薬剤代謝関連遺伝子のゲノム変異と代謝活性解析情報
- メタゲノムページ
微生物種の存在量を種々のカテゴリ (サンプル種別・歯周病の重篤度等) ごとに表示
- ダウンロードページ (図には未掲載)
jMorp 掲載データのバルクダウンロード
- 全ゲノムサンプルレポジトリ (図には未掲載)
短鎖全ゲノム解析対象検体に関して、短鎖全ゲノム解析の品質情報 (塩基数・平均深度) 及び、SNPアレイ・メタボロームなどの短鎖全ゲノム情報以外の情報の availability を纏めたページ
- コードレポジトリ (図には未掲載)
TMM 内で開発されたソフトウェア等のレポジトリ
各ページの利用方法に関しては jMorp Webサイト利用方法 を参照して下さい。