2.8. 代謝物ページ

jMorp では複数のプラットフォームで解析した代謝物について、プラットフォーム別の代謝物ごとに、濃度の頻度分布や年齢・性別による傾向、他の代謝物との相関、 また代謝物によっては、妊娠状態による違いや経時的な変化について一覧できるページを用意しています。 jMorp トップページの検索ボックスから代謝物名や MS による質量電荷比 (m/z) で検索を行うと、対応する代謝物のページが開かれます。 また、jMorp トップページ右側にある Metabolome 2023 をクリックすると、代謝物データの一覧が表示されます。

ここから先の節では Glutamic acid の代謝物ページ (https://jmorp.megabank.tohoku.ac.jp/metabolome/TCN000015) を例にしてパネルごとの内容を説明します。 データセットそのものについては こちら を参照して下さい。

2.8.1. 代謝物情報パネル

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このパネルでは、代謝物ID・代謝物の構造、代謝物の Common name、 Local name (旧 jMorp での代謝物名)、 解析プラットフォーム及び手法、自動定量における精度 (NMRのみ)、 m/z や retention time (MS global target analysisのみ)、 他のDBにおける代謝物IDなど、代謝物に関する基礎的な情報が表示されます。

注釈

代謝物ID、および NMR 自動定量における精度情報に関しては このページ に記載があります。 あわせて参照して下さい。

2.8.2. 濃度分布パネル

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このパネルでは、性別毎や年齢層毎の代謝物の分布、および、性別や年齢層が異なる場合の濃度の違いについての検定結果が表示されます。

2.8.3. 食後時間パネル

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このパネルには血漿中代謝物濃度の食後経過時間による違いが表示されます。

2.8.4. 妊娠状態比較パネル

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このパネルでは、妊娠中、および産後1か月の女性と、同年齢の妊娠していない女性との濃度分布が表示されます。

2.8.5. 経時変化パネル

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このパネルでは、コホート調査において、数年の間隔を経て採血された代謝物について、横軸に初回、縦軸に2回目の濃度が表示されます。 プロット左上のボックスを選択することで、性別毎、年齢層毎、また遺伝的要因による濃度の違いが報告されたものについては、genotype毎に色分けした表示が可能です。

2.8.6. 代謝物相関パネル

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このパネルでは、代謝物データセット内において、同一人物で異なる解析プラットフォーム・異なる代謝物について解析値があるものについて、代謝物間の相関を表示しています。

右上の View as netwok ボタンをクリックすると、テーブル形式で表示している相関関係をネットワークとしてグラフィカルに表示します。 相関ネットワークの詳しい利用方法は 次の章 で説明します。

注釈

jMorp では Spearman 相関係数 の絶対値が 0.2 以上かつ p 値が 10-5 以下の相関関係のみを掲載しています。

2.8.7. GWASパネル

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このパネルでは、表示ページの代謝物についてGWAS統計量の登録がある場合、その情報を表示します。

2.8.8. メタボリックインデックスパネル

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このパネルには年齢と性別で層別化した指標が表示されます。