2.5. CNVページ
jMorp では Copy Number Variation の解析結果を公開しています。本ページでは 1kbp ごとにコピー数多型を解析した結果を閲覧できます。
2.5.1. CNVページへの行き方
CNVページへ行く方法は2通りあります。
ゲノムブラウザ で「ToMMo JCNVv1 (link to jMorp)」のトラックを表示し、各領域を右クリックして「Show in jMorp」を選ぶ
遺伝子ページ のCNVパネルで「jMorp CNV ID」列の各IDをクリックする
以上のどちらを使っても本ページに辿り着くことができます。
2.5.2. CNVページの内容
CNVページは「General information」、「Frequency」、「Overlapping SNVs/INDELs」、「Genome Browser」の4つのパネルからなります。
General informationパネルには領域と重なっている遺伝子名が表示されます。
Frequencyパネルには以下の図のように各データセットごとのコピー数の頻度とヒストグラムが表示されています。

Overlapping SNVs/INDELsパネルではこの領域に存在するSNVとINDELのリストが表示されています。 Position/Alleles列の中をクリックすることで、それぞれの SNV/INDEL ページ に飛ぶことができます。
Genome Browserパネルでは周辺領域をゲノムブラウザで確認することができます。